微生物實驗室主要是對微生物的分離、培養(yǎng)、育種、鑒別、形態(tài)、變異、利用、危害等方面進行實驗和研究，食品微生物實驗室主要檢測項目有：酵母、乳酸菌、雙歧桿菌、罐頭商業(yè)無菌、菌落總數(shù)、大腸菌群、霉菌、致病菌（如沙門氏菌、志賀氏菌、溶血性鏈球菌、金黃色葡萄球菌等），應該將實驗室建在遠離生活區(qū)，清潔安靜的場所；要與生產(chǎn)加工車間較近的距離，方便扦樣與檢驗。

根據(jù)中華人民共和國衛(wèi)生行業(yè)標準WS233-2002《微生物和生物醫(yī)學實驗室通用準則》以及國家標準GB19489-2004《實驗室生物通用要求》，生物實驗室分為一級、二級、三級、四級，習慣上稱為P1、P2、P3、P4。二級生物實驗室對人體、動植物或環(huán)境具有中等危害或具有潛在致病因子，對健康成人、動物和環(huán)境不會造成嚴重危害，具有有效的預防和措施。

1.接種時必須穿工作服、戴工作帽。

2.進行接種食品樣品時，必須穿專用的工作服、帽及拖鞋，應放在無菌室緩沖間，工作前經(jīng)紫外線后使用。

3.接種食品樣品時，應在進無菌室前用肥皂洗手，然后用75％酒精棉球將手擦干凈。

4.進行接種所用的吸管，平皿及培養(yǎng)基等必須經(jīng)，打開包裝未使用完的器皿，不能放置后再使用，金屬用具應高壓或用95%酒精點燃燒灼三次后使用。

5.從包裝中取出吸管時，吸管尖部不能觸及外露部位，使用吸管接種于試管或平皿時，吸管尖不得觸及試管或平皿邊。

6.接種樣品、轉種必須在酒精燈前操作，接種或樣品時，吸管從包裝中取出后及打開試管塞都要通過火焰。

7.接種環(huán)和針在接種前應經(jīng)火焰燒灼全部金屬絲，必要時還要燒到環(huán)和針與桿的連接處，接種結核菌和烈性菌的接種環(huán)應在沸水中煮沸5min，再經(jīng)火焰燒灼。

8.吸管吸取菌液或樣品時，應用相應的橡皮頭吸取，不得直接用口吸。

為確保實驗室內(nèi)的氣流由“清潔”區(qū)域流向“污染”區(qū)域，實驗室內(nèi)不應使用雙側均勻分布的排風口布局。不應采用上送上排的通風設計。由生物柜排出的經(jīng)內(nèi)部過濾的空氣可通過系統(tǒng)的排風管直接排至大氣，也可送入建筑物的排風系統(tǒng)。應確保生物柜與排風系統(tǒng)的壓力平衡。