北京兒童醫(yī)院共有在職職工3210人，其中醫(yī)生968人，護士1325人，醫(yī)技462人。正高級職稱292人，副高級職稱380人，中級職稱692人。醫(yī)院擁有中國現(xiàn)代兒科學奠基人諸福棠、中國兒童血液腫瘤學開創(chuàng)者胡亞美、中國小兒外科創(chuàng)始人之一張金哲等國內(nèi)兒科界僅有的三位院士，以及突出貢獻專家、享受政府特殊津貼人員、新世紀百千萬人才工程人選、國家杰出青年科學基金獲得者等眾多高層次人才。

北京兒童醫(yī)院積極發(fā)揮學科龍 頭作用，領航兒科行業(yè)發(fā)展。2013年牽頭組建北京兒童醫(yī)院集團，創(chuàng)新“病人不動、醫(yī)生移動”的模式服務全國患兒，目前理事單位成員已達57家。醫(yī)院與美國、俄羅斯、加拿大、意大利、澳大利亞、瑞典、德國、法國、日本、新加坡等國家的兒童醫(yī)療機構和科研院所建立了良好的關系和廣泛的合作，是科技部認定的兒童重大疾病國際科技合作基地。

北京兒童醫(yī)院精神科一直堅持心理健康應該從娃娃抓起。在兒童心理健康領域做了大量探索的工作，其中以腦與認知神經(jīng)科學為主。先后承擔和參與了一系列重大的兒童神經(jīng)發(fā)育領域的科研項目。

2019年1月由中國醫(yī)師協(xié)會和醫(yī)師報主辦的推動行業(yè)前行的力量——第四屆《醫(yī)師報》醫(yī)學家峰會推選國家兒童醫(yī)學中心首都醫(yī)科大學附屬北京兒童醫(yī)院精神心理科榮獲2018年中國健康公益星十大公益醫(yī)院/科室獎。