無菌室外要設一個緩沖間，錯開門向，以免氣流帶進雜菌。無菌室和緩沖間都必須密閉、室內裝備的換氣設備必須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環(huán)境和無菌材料后，只有保持無菌狀態(tài)，才能對某種特定的已知微生物進行研究。

無菌車間又叫無菌室，它的要求更高，除了按潔凈室要求處理空氣中微粒外，還需要對室內空氣進行處理，即同時要去除生物污染源，對室檢查還需要對室內空氣采樣培養(yǎng)，以杜絕感染源。醫(yī)院手術室、血液透析室、藥品及三類一次性醫(yī)療用品生產都要求使用無菌室；但是檢測時需要檢測浮游菌、沉降菌等菌落數。

無菌潔凈車間的內部裝修要求房間圍護結構的空氣密封性好，房內無衛(wèi)生死角，裝修材料表面光潔但不反光、耐壓力而不起塵、易于清潔、不易發(fā)生霉變和長菌、能夠適應各種劑和氣體熏蒸的腐蝕和紫外線照射。

無塵無菌車間一般是在微生物實驗室內專辟一個小房間?？梢杂冒宀暮筒ＡЫㄔ臁Ｃ娣e不宜過大，約4 ~5 平方米即可，高2.5 米左右。無菌室外要設一個緩沖間，緩沖間的門和無菌室的門不要朝向同一方向，以免氣流帶進雜菌。無塵無菌車間和緩沖間都必須密閉。室內裝備的換氣設備必須有空氣過濾裝置。